楽天倉庫のRSLと自社倉庫を利用し、楽天とshopifyを運営しています。

ネクストエンジンと契約をして在庫管理を開始したのですが、
shopifyには基本拠点であるRSLの在庫数のみが反映され、自社倉庫に在庫が有っても基本拠点のRSLの在庫が0の場合、shopifyでは売り切れ表示になってしまうようです。

RSLで在庫が0になってしまうことがよく有るので、アプリでもなんでも良いので、
RSLと自社倉庫の在庫の合算値がshopifyに反映されるようにすることは出来ないのでしょうか？
もしくは、RSLの在庫が0になったときのみ自社在庫がRSL在庫に上書きされるような・・・

以前使用していたBOSSでは合算値が反映されていたので盲点で困っています…。
なぜネクストエンジンでは合算が反映されないのか・・・

今後改修予定がないのか、何らかの対策をされている方が居ないのか知りたいです。