シマッチです。
いつも大変お世話になっております。

お忙しい中申し訳ございませんが、表題の件につき解決方法をご教示いただけますでしょうか。

昨日からRMSで「ヘッダー・フッター・レフトナビのテンプレート設定」を更新する中で、
HTTP://の部分を//に変更するなどを行っていたのですが、

楽天トップページで、ヘッダー、サイド、フッター、その他バナー（ Javascript を使用したスライド画像）等をGOLDにアップし、
iframeで読み込んでいるのですが、どうやら正しく表示されないようになってしまいました。

※楽天サーチから商品個別ページを表示した場合、itemから始まるURLではiframe部分も正しく表示されてますが、
　トップページhttpsから始まるページでは正しく表示されません。

クローム→「このページは承認されてないソースからのスクリプトを読み込もうとしてます」と表示。
ie　　 →「セキュリティで保護されているコンテンツのみ表示」

別PC（mac）では、

サファリ→特に警告は出ませんがiframe部分は表示されておりません。
firefox→このWEBサイトには運営者を証明する証明書がありません。

といった状況です。ECステーションさんのツール（カレンダー）や、イベント告知君も正しく表示されていません。
恐れ入りますが解決方法をご教示いただけますでしょうか。

何卒よろしくお願いいたします。