お世話になります。

今回は本店サイトの質問をさせて下さい。

10年ほど前に、取り扱い商品の紹介やお知らせ用に本店サイト（*****.com）を立ち上げました。

それから、2～3年して本店サイトにもショッピング機能を付けようということで、カラーミーで別ドメイン（*****.co.jp）で同じレイアウトのページを作り本店サイトのショッピングページとしてスタートさせました。

お客様からは、同サイト内で回遊しているように見えますが、実は（*****.com）と（*****.shop-pro.jp）を行ったり来たりしている感じです。

例：
本店サイト：http://doronco.zomco.biz/
ショッピング：http://doronco.shop-pro.jp/

お客様の利便性は保たれているため、そのまま運営を続けていましたが、今後SEO的にも作業効率的（修正するたびに2店舗のレイアウトの修正をしないといけません）にもこのまま続けていっていいのか悩んでおります。

GOOGLEで会社名で検索した時には本店サイトしかヒットしないので、このようなサイト作りはスパム扱いとかになるのかもしれないと最近になって心配になってきました。

選択肢としては

1】　このまま続けていく

2】　本店サイトは会社概要や連絡事項のみとし、ショッピングサイトと完全に切り離して（レイアウトを分けてリンクも切る）、2つを運営していく

3】　本店サイトを潰して、ショッピングサイトドメインを移行し統合する

だと思っておりますが、このような場合どれが一番いいのでしょうか？

ご回答よろしくお願いいたします。