現在Amazonにも質問中のため、注意喚起をかねて投稿させていただきます。
同機能をご利用中の店舗様がいらっしゃいましたら、ご注意ください。

Amazonのカスタマイズプログラム機能を利用してオプションを設定した商品において、お客様が金額加算になるオプションを選択した際、【セール対象の商品で注文確定時にオプション料金が反映されない事象】が起きています。
Amazonのテクニカルサポートに依頼し現在調査中ですが、同様のトラブルが発生し回答をもらっている店舗様がいらっしゃいましたら、対応方法等ご教示いただけますと幸いです。

■ 症状
商品ページとカートではオプション料金加算後の金額になりますが、レジに進むと本体価格だけになり、そのまま決済される。
お客様にもオプション加算前の価格で請求がかかっており、注文詳細・納品書にもオプション価格は入りません。
結果として、オプション分の代金を受け取れないままオプション付きの商品を製作・発送する状態に。

■ 状況
・セール開始前の注文までは正常、開始後の注文から反映されなくなった。
・セール対象外の商品は正常に加算されている。
・複数の商品・注文で同じ状態
（推測）セール価格が ASIN 単位で再適用され、加算分を上書きしている…？

■ Amazon の現時点の回答
原因不明で調査中。不足分は補填される可能性があるとのことですが、確約ではありません。

■ 同じ設定の方へ
セール参加中で 、カスタマイズプログラム機能のオプションに加算価格を付けている方は、
セール開始以降の注文の請求金額をご確認ください。
加算されていなければ、ASINや注文番号等必要情報とカートやレジのスクリーンショットを添えてテクニカルサポートへ。

当店は補填を待たず、該当商品から加算オプションをいったん削除し、オプション付きの仕様は別商品として出品する予定です。