RSL出荷分（BOSS）からRMSへの出荷実績反映について、お聞きしたいことがあります。

当店では今後自社出荷とRSLの併用を予定しており、現在準備中です。

添付画像をご確認いただきたいのですが、
注文テストしまして、BOSSで処理⇒RSLから出荷された後の、
RMS側＞注文詳細の「配送会社」、「お荷物伝票番号」の反映を確認したところ
1つ目に上書きされるのではなく、2つ目として追加されてしまっています。

この状態ですと、RMSでは出荷が完了しているという判定にならず、
発送待ちのところに残り続けてしまうそうです。
こちら何か回避策や設定の変更等で、対策することはできますでしょうか。

楽天のBOSSサポートに聞いたところ、1件ずつ手で修正するよう言われてしまいましたが
数件なら良いものの、100件超の場合この方法は現実的ではありません。

1つ目のところに上書きされるようにどのように設定すれば良いのか
お手数をおかけしますが、ご回答いただけますでしょうか。