お世話になっております。
ECステーションさんのお店つくーるでトップページやヘッダー等を作っているのですが
https://manual.ecsystem.jp/pc_header_footer/
↑こちらと同じ方法で反映し、実際にページを見ると見切れていたり、間が空いてしまっていたりしてしまいます。
シークレットモードで見たりしたのですがやはり見切れていたりしています。
heightを自分で変えてみたりしたのですがなかなかうまくできず困っています。

なにか間違った方法でやってしまっているのか、それともみなさん同じ状況なのでしょうか？